Przyczyną kolek u dzieci mogą być: zaburzenia czynności przewodu pokarmowego związane z jego niedojrzałością, wrażliwość systemu nerwowego na warunki zewnętrzne i dużą ilość bodźców, łapczywe jedzenie i związane z tym łykanie dużej ilości powietrza, nietolerancja pokarmowa na któryś ze składników diety mamy, alergia pokarmowa na białka mleka krowiego, nietolerancja laktozy, napięcie, niepokój i stany lękowe u mamy lub obojga rodziców.